Les entrées et les sorties d'une application sont organisées en Java autour du modèle des flots (anglais stream), à l'aide d'un ensemble très développé de types, mettant en 3#3uvre divers patterns. Un flot est une suite de données (octets, caractères, objets quelconques) successivement lues ou écrites. Ces flots sont ainsi classifiés en flots d'entrée (qui comportent des méthodes de lecture), et en flots de sortie (qui comportent des méthodes d'écriture). Outre l'application, un flot d'entrée est connecté à une source, et un flot de sortie à une cible. La source ou la cible d'un flot peut être un fichier, un tampon en mémoire, une chaîne de caractères, un autre flot, une ressource Web ou bien un port Internet. Un type de flot est donc caractérisé par trois éléments : le type des données, sa direction et sa connectivité.